采集原始菌群比較好在當地林木茂密的山上選點，樹木越多，生長年頭越長，其林下積累的枯枝落葉就越多，這些枯枝落葉在各種生物菌的作用下形成厚厚的一層落葉土，這種落葉土就富含各種土著菌。采集時間比較好在早春進行，早春的溫度較低，有利于發酵用酵母菌的繁殖，而不利于細菌、放線菌等的繁殖。米飯是微生物的喜歡，用電飯煲蒸一鍋米飯；等米飯涼后松散開，并埋入林下的落葉土中；大概10天左右米飯中就會出現大量白色的菌絲(溫度高時時間會短些)；這樣米飯團就變成了富含各種土著菌，特別是酵母菌的原始菌群了(圖1)。其實在林下收集有白色菌絲的樹皮、落葉也可用來直接制作菌劑。方便的地方直接用落葉土(10%的比例)和堆肥原料一起堆肥也可以。a.將米飯埋入落葉土中。b.取出富集原始菌的飯團。c.收集到的原始菌群。d.將原始菌群和麥麩一起發酵。e.及時翻倒。f.將陰干的菌肥裝袋放置：打破了普通有機肥的“專一性”“局限性”的固有弱點，這是其它生物肥料無法比擬的。河南通常生物菌肥咨詢報價
微生物的秘密：有人問：憑什么把微生物肥料說的那么好？到底好在那了？答：“你可知道沙漠和良田的區別在哪里嗎？”它的主要區別是良田里有有機質和微生物。我們常說，沒有有機質，就沒有肥沃的土壤。有機質對農作物是極其重要的，是農作物的重要營養來源。而土壤中的微生物能分解土壤中的動植物殘體，形成越來越小的有機分子，這就是腐殖質有機質，是豐富的植物營養來源。同時，微生物與根系、根際土壤一起組成了農作物的‘腸胃’，很多有益微生物與根系形成互補共生關系，在農作物各種營養的轉化和吸收過程中，發揮主要作用，礦物質元素多數依靠微生物的活動變為農作物可吸收的狀態。而且有益微生物是農作物的衛士，協助抵抗病蟲侵害。”湖北常規生物菌肥售后保障這樣就抑制和減少了病原的入侵和繁殖機會，起到了減輕作物病害的功效（可以形象理解為“以邪壓正”了）。
有機生物菌肥內含有大量的土壤微生物菌劑，這些微生物能夠釋放土壤中的不可溶性磷鉀等肥料元素，施用后增效顯著。但是，這類微生物多是好氣性菌類，它們的一切生命活動，都需要適宜的溫度、水分和適量的氧氣。因此，必須在高溫燜室以后才能施用，以免燜室時因土溫高，使之失去活力，而且要淺施，入土深度5～8厘米為好，不可深于10厘米，防止深層土壤氧氣不足，影響微生物的活性，降低使用效果。對含硫高的土壤和銹水田，不宜施用生物菌肥，因為硫能殺死生物菌。對于翻漿的水田，一般不用撒肥，可采用噴霧的方法，效果更明顯。施用菌肥的比較好溫度是25～37℃，低于5℃，高于45℃，施用效果較差。對高溫、低溫、干旱條件下的農作物田塊不宜施用。同時還應掌握固氮菌適溫度，土壤含水量是60～70%左右。
施用有機菌肥的關鍵要不斷培養土壤中的微生物。土壤中有足夠的有機物或腐殖質時才能被微生物菌利用，進而使土壤微生物快速繁衍，***營養元素。實行果園生草制。草長到15厘米不到20厘米時割刈，一年反復進行覆蓋地面，兩年全園普翻一次以利提高果園腐殖質的含量。施發酵好的牛、豬、羊、兔等家畜禽糞。為有機菌肥中菌種的發酵繁殖提供充足的基質。為果樹在生長中提供中、微量元素，減少小葉、黃葉等生理病害的發生。微生物菌在土壤中作用主要是產生各種酶，分解各種養分，產生各種酸和二氧化碳，給作物提供更多養分。而微生物菌要成活和繁殖，土壤中要有足夠的有機質才行。微生物肥料是以微生物的生命活動導致作物得到特定肥料效應的一種制品.
所以大部分生物菌的活菌在包裝之前多就是抽離水分的干燥處理而已，在包裝過程中往往還有許多活菌處于活躍狀態，它們在包裝后的貯存期間必須進行自我休眠，但在這個過程中，活菌會死掉不少。這也是市面上活菌制劑的質量良莠不齊的主要原因之一。而生物菌肥里的活菌往往在包裝之后不能自動休眠，而始終處于活躍狀態。一旦貯藏的時間過長，這些活菌基本上都死了，只剩下普通肥料的肥效。還有就是，無論是在包裝之前就進入休眠狀態的活菌，還是包裝后自動休眠的活菌，肯定都需要一個***的過程。但是許多生物菌劑或者生物菌肥的廠家都在其推廣宣傳中忽略了這一點，導致農民在使用方法上無法做到科學準確，自然也就得不到預期的效果了。國家標準規定，“農用微生物菌劑產品、液體制品保質期為3個月，粉劑及顆粒制品為6個月。廣西經濟型生物菌肥廠家直銷
近幾十年來，主要施用化學肥料，但隨著化肥的大量施用，人們清醒的認識到化肥及化肥工業帶來的危害.河南通常生物菌肥咨詢報價
土壤中施入較多的菌肥，雖然不會出現燒根燒苗現象，但也并不是施得越多就越好。盲目大量施用生物菌肥，雖然不會向化學肥料那樣造成蔬菜燒根死苗，只是蔬菜植株體內鹽類積累增加，有害消費者的圣體健康，惡化土壤質地，但**起碼增加了肥料投入成本（因為生物菌肥價格較高），降低蔬菜的栽培效益。因此，應根據不同作物的需要和土壤養分狀況，科學地確定生物菌肥施肥量，才能達到增產增收的目的。在土壤狀況比較正常的情況下，一般以畝（667平方米）施用生物菌肥80公斤左右為宜。如果土壤鹽漬化程度較高，可適當增加生物菌肥的施用量。一般根據土壤的鹽漬化程度高低，每畝（667平方米）可適當增施10～20公斤為宜。河南通常生物菌肥咨詢報價